Inferring Cell-Cell Interaction Dynamics from Cell Trajectory Data Using Deep Attention Networks
本論文は、生物学的メカニズムに関する事前の仮定を必要とすることなく、軌跡データから細胞間相互作用のダイナミクスを支配する特定の規則を正確に推論および可視化する、ディープアテンションネットワークに基づくモデルと、それに付随する解釈可能性ツールキットを提示するものである。
393 件の論文
細胞生物学は、生命の最小単位である細胞の仕組みを解き明かす分野です。私たちが食べるものから呼吸する空気まで、あらゆる生命活動は細胞レベルの複雑な動きによって支えられています。この分野では、細胞がどのように生まれ、分裂し、そして機能しているのかを深く探求します。
Gist.Science は、生体医学分野のプレプリントサーバーである bioRxiv から公開される最新の論文をすべて収集・処理しています。専門的な技術的な要約だけでなく、難しい用語を避け、誰でも理解できる平易な解説も併せて提供しており、最新の研究成果を直感的に把握できるようサポートします。
以下に、細胞生物学のカテゴリーで最近発表された論文の一覧を示します。
本論文は、生物学的メカニズムに関する事前の仮定を必要とすることなく、軌跡データから細胞間相互作用のダイナミクスを支配する特定の規則を正確に推論および可視化する、ディープアテンションネットワークに基づくモデルと、それに付随する解釈可能性ツールキットを提示するものである。
本研究は、LmME2が*Leishmania major*における初の細胞質性リンゴ酸酵素であることを特定および特性評価し、その欠損がピリジンヌクレオチドの恒常性と酸化還元バランスを崩し、それによって寄生虫の生存と毒性を損なうことを実証しており、これを有望な創薬標的として浮き彫りにしている。
本研究は、ヒトiPSC由来造血幹細胞が、ドナーの年齢に依存することなく、分化および連続的な移植過程を通じて、持続的かつ若々しいエピジェネティックな特性と回復したテロメア長を保持していることを実証しており、これにより再生医療への応用における枠組みを確立するものである。
本研究は、p70S6キナーゼがAP2 2サブユニットのセリン45をリン酸化することで、AP2複合体の構造ダイナミクスを調節し、それによって主要な細胞表面受容体の内部移行を促進し、クラスリン介在性エンドサイトーシスを促進することを実証している。
本論文は、オーストラリア・ニュージーランド細胞外小胞学会(ANZSEV)の会員を対象に実施された調査の結果を提示するものであり、その研究コミュニティの構成、関心、および信念を特徴付けるものである。
本研究は、マウス精祖細胞および前駆細胞に関する初の包括的なプロテオミクスおよびリン酸化プロテオミクス・データベースを確立し、運命決定において翻訳後リン酸化がタンパク質発現よりも明確な調節的役割を果たすことを明らかにし、阻害によって分化を損なう主要なキナーゼを特定するとともに、特定のタンパク質をノックアウトモデルにおける精巣の表現型へと結びつけた。
本研究は、Netrin-1が、細胞外からの合図、細胞内シグナル伝達、およびエピジェネティックな再構成を調整することで、ヒト未分化多能性の重要な守護者として機能し、ヒト胚性幹細胞におけるナイーブ状態の維持およびその獲得を加速させることを明らかにしている。
本研究は、老化ヒト筋芽細胞が高濃度の抗酸化物質による還元ストレス誘発性の細胞死に対して選択的に感受性を持つことを実証しており、多くの天然成分のセノリティック活性は、この特定の種類のストレスを誘導する能力に由来している可能性を示唆している。
本論文は、空間分解能とサンプルサイズの間のトレードオフを克服し、大規模な細胞集団における個々のオルガネラ形態および空間的不均一性の堅牢かつ定量的なプロファイリングを可能にする、スケーラブルで高スループットな拡張顕微鏡パイプラインであるHiExMを導入するものである。
本研究は、Stu2/XMAP215ファミリーの微小管ポリメラーゼが、その活性がTOGドメインの結合速度論によって制御される効率的な酵素様チューブリン・シャトリング・アンテナとして機能することを実証することにより、それらの定量的生化学的メカニズムを確立し、アクチンポリメラーゼとの収斂進化の事例を明らかにしている。